工程施工许可证由工程所在地县级以上人民政府建设行政主管部门办理。

《中华人民共和国建筑法》第七条建筑工程开工前，建设单位应当按照国家有关规定向工程所在地县级以上人民政府建设行政主管部门申请领取施工许可证;但是，国务院建设行政主管部门确定的限额以下的小型工程除外。按照国务院规定的权限和程序批准开工报告的建筑工程，不再领取施工许可证。第八条申请领取施工许可证，应当具备下列条件：

(一)已经办理该建筑工程用地批准手续;

(二)在城市规划区的建筑工程，已经取得规划许可证;

(三)需要拆迁的，其拆迁进度符合施工要求;

(四)已经确定建筑施工企业;

(五)有满足施工需要的施工图纸及技术资料;

(六)有保证工程质量和安全的具体措施;

(七)建设资金已经落实;

(八)法律、行政法规规定的其他条件。建设行政主管部门应当自收到申请之日起十五日内，对符合条件的申请颁发施工许可证。

施工许可证管理办法

一、规范办理的程序

新政策规定在许可证明文件短缺或者出现证件失效的情况之下，有关部门应该在当场或者在5日之内告知建设单位将所有的证件补充齐全，除此之外，县级以上的有关筑建部门不具备增设办理许可证的条件。

二、建立事后的监查制度

新政规定有关的发证机关需要建立颁发施工许可证之后的一系列审查制度，对获得施工许可证的单位进行监督，一但获得施工许可证的单位出现条件发生变化、延期进行开工、中途停止施工等问题，甚至出现违法违规的行为，一定要进行及时的处罚处理。

通过上述介绍可知，工程施工许可证由由工程所在地县级以上人民政府建设行政主管部门办理。如果有其他相关问题想要了解，欢迎咨询律盾的免费法律咨询，可以帮助你解答疑惑。